- Caratterizzazione fenotipica con metodi classici ed eventualmente mediante test commerciali (gallerie API)
- Caratterizzazione molecolare sulla base della analisi della sequenza parziale o totale del 16S rDNA (Stackebrandt et al., 2002)
- Analisi filogenetica (Tamura et al. 2013; Saitou & Nei, 1987; Jukes & Cantor, 1969)
- Fingerprinting del DNA e biotipizzazione
Bibliografia
-Jukes, T. H. & Cantor C. R. (1969). Evolution of protein molecules. In Mammalian protein metabolism, pp. 21-132. Edited by H. N. Munro. New York: Academic press.
-Saitou, N. & Nei, M. (1987). The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Mol. Biol. Evol. 4, 406-425.
– Stackebrandt, E., Frederiksen, W., Garrity, G. M., Grimont, P., Kampfer, P., Maiden, M., Nesme, X., Rossello-Mora, R., Swings, J., Truper, H. G., Vauterin, L., Ward, A. C. & Whitman, W. B. (2002). Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology. Int J Syst Evol Microbiol 52, 1043-1047.
– Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. 2013. Mol. Biol. Evol.30(12):2725–2729.